Ketersediaaan dan kelengkapan prasarana PS MPWK-PPs Uncen adalah:
Laboratorium PS MPWK-PPs Uncen saat ini masih bekerjasama dengan laboratorium Prodi Teknik Sipil Uncen
Ruang kerja mahasiswa PS MPWK-PPs Uncen saat ini belum ada dan masih digabung dengan ruang kuliah
Fasilitas ruang kuliah PS MPWK-PPs Uncen adalah sebanyak 2 ruangan, yaitu ruang Kelas “A” dan ruang Kelas “B” dengan ukuran 8×8 m. Masing-masing ruangan dilengkapi dengan kursi kuliah, infocus (proyektor), papan tulis, pendingin ruangan (AC) dan juga terdapat fasilitas wifi untuk menunjang kinerja mahasiswa. Kedua ruangan ini berada di gedung PPs-Uncen.
Fasilitas ruang bersama untuk seminar/ kuliah umum sebanyak satu buah.
Auditorium Universitas Cenderawasih yang dapat digunakan jika PS MPWK-PPs Uncen melaksanakan kegiatan dengan peserta yang lebih banyak
Untuk fasilitas perpustakaan, PS MPWK-PPs Uncen memunyai satu ruangan perpustakaan. Selain itu mahasiswa juga dapat menggunakan perpustakaan PPS-Uncen, perpustakaan Fakultas Teknik Uncen dan perpustakaan Utama Uncen.
Prasarana olahraga dan seni dari PS MPWK-PPs Uncen, saat ini belum ada, dan masih menggunakan sarana prasarana olahraga dan seni dari Uncen.
PS MPWK-PPs Uncen memiliki koleksi buku dan jurnal ilmiah yang tersebar di perpustakaan PS MPWK-PPs Uncen, perpustakaan PPs-Uncen, perpustakaan Fakultas Teknik dan perpustakaan Universitas Cenderawasih.